答：

款项的收付和发票的开具应该保持一致性，即收款方应与开票方一致。如果客户将款项打到总公司账上，而由分公司提供发票，可能会引起税务机关的关注和质疑，因为这可能存在三流不一致（资金流、发票流、货物流）的问题。