您好，若出口企业在发票系统误将用于抵扣的发票勾选成出口退税发票，企业可在出口退税申报系统填写《进货凭证信息回退申请表》，经过数据生成后，电子数据可报到主管税务机关，经主管税务机关审核后，企业可在发票系统查询到已撤回的发票信息。

具体操作方式分以下三种情形处理：

一、如发票还未操作“用途确认”发现勾选错误时，可以直接取消“出口退税勾选”。

二、如发票已“退税勾选”且已操作“用途确认”，但尚未用于退税申报时，需要提交相关申报数据至主管税务机关审核后，方可冲红。

具体步骤为：登录电子税务局，点击【我要办税】-【出口退税管理】-【出口退(免)税申报】-【进货凭证信息回退申请】模块，进行明细数据采集，采集成功后显示“数据生成成功”，审核状态显示“待审核”，税务机关审核通过后，即可进行红冲操作。

三、如发票已经操作“用途确认”并已申报退税，且符合开具“出口转内销证明”的条件，应向退税的主管税务机关申请开具“出口转内销证明”，税务机关审核通过后可继续到“抵扣勾选”模块办理勾选认证。